Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc47Q9D024 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms