Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Elp3Q9CZX0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms