Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gins3Q9CY94 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms