Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Malsu1Q9CWV0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Malsu1Q9CWV0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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