Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tdrd12Q9CWU0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms