Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx10Q9CWT3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx10Q9CWT3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.1 ms