Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb2bQ9CWF2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms