Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc1aQ9CU62 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms