Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lhfpl3Q9CTN8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms