Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rprd1bQ9CSU0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rprd1bQ9CSU0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms