Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Snw1Q9CSN1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms