Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NmbQ9CR53 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms