Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop4Q9CR08 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pop4Q9CR08 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pop4Q9CR08 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pop4Q9CR08 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pop4Q9CR08 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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