Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mrpl35Q9CQL6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mrpl35Q9CQL6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mrpl35Q9CQL6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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