Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer1Q9CQL2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms