Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ4

Rnf2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf2Q9CQJ4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf2Q9CQJ4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms