Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed6Q9CQG0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms