Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQF4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQF4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQF4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQF4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQF4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQF4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQF4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQF4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQF4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9CQF4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQF4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQF4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQF4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQF4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQF4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQF4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQF4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms