Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms