Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ89

Cuta, Protein CutA, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CutaQ9CQ89 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CutaQ9CQ89 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CutaQ9CQ89 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CutaQ9CQ89 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CutaQ9CQ89 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CutaQ9CQ89 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CutaQ9CQ89 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CutaQ9CQ89 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CutaQ9CQ89 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CutaQ9CQ89 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CutaQ9CQ89 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CutaQ9CQ89 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CutaQ9CQ89 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CutaQ9CQ89 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CutaQ9CQ89 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CutaQ9CQ89 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CutaQ9CQ89 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CutaQ9CQ89 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CutaQ9CQ89 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CutaQ9CQ89 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CutaQ9CQ89 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CutaQ9CQ89 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CutaQ9CQ89 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CutaQ9CQ89 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CutaQ9CQ89 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CutaQ9CQ89 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CutaQ9CQ89 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CutaQ9CQ89 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CutaQ9CQ89 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CutaQ9CQ89 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CutaQ9CQ89 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CutaQ9CQ89 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CutaQ9CQ89 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms