Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp3Q9CQ10 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
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