Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg3Q9CPX6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg3Q9CPX6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms