Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt88Q9CPR6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt88Q9CPR6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt88Q9CPR6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms