Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Bcl11bQ99PV8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Bcl11bQ99PV8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bcl11bQ99PV8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms