Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe41Q99PV5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms