Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b1Q99NB9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3b1Q99NB9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms