Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms