Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BrapQ99MP8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms