Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tlr3Q99MB1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tlr3Q99MB1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr3Q99MB1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms