Protein–RNA interactions for Protein: Q99LL3

Chst12, Carbohydrate sulfotransferase 12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst12Q99LL3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chst12Q99LL3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chst12Q99LL3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms