Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rcbtb2Q99LJ7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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