Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms