Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms