Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms