Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms