Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Reep3Q99KK1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms