Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hps4Q99KG7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms