Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX7

Nxf1, Nuclear RNA export factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf1Q99JX7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nxf1Q99JX7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nxf1Q99JX7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nxf1Q99JX7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms