Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Def8Q99J78 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms