Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Derl1Q99J56 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms