Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctu1Q99J10 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms