Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo1Q924W9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms