Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xrcc4Q924T3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc4Q924T3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms