Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ripply3Q924S9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ripply3Q924S9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ripply3Q924S9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ripply3Q924S9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms