Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Nrif1Q923B3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms