Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpf3Q922U1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms