Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Riok1Q922Q2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Riok1Q922Q2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms