Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tubb6Q922F4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms