Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q2

Rev1, DNA repair protein REV1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rev1Q920Q2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rev1Q920Q2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rev1Q920Q2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rev1Q920Q2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rev1Q920Q2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rev1Q920Q2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rev1Q920Q2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rev1Q920Q2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rev1Q920Q2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rev1Q920Q2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rev1Q920Q2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rev1Q920Q2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rev1Q920Q2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rev1Q920Q2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rev1Q920Q2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rev1Q920Q2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rev1Q920Q2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rev1Q920Q2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rev1Q920Q2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rev1Q920Q2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rev1Q920Q2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rev1Q920Q2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rev1Q920Q2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rev1Q920Q2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rev1Q920Q2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rev1Q920Q2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rev1Q920Q2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rev1Q920Q2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rev1Q920Q2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rev1Q920Q2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rev1Q920Q2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rev1Q920Q2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rev1Q920Q2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rev1Q920Q2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rev1Q920Q2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rev1Q920Q2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rev1Q920Q2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rev1Q920Q2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rev1Q920Q2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms