Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smc1bQ920F6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms